26 maggio 2012

9-Year-Old food critic blogger shakes up school meals

mal from Martha Payne The lunches served at one primary school in Scotland were not always palatable. Then Martha Payne, 9 years old, she started a blog: Never Seconds One primary school pupil's daily dose of school dinners.
Friday, 25 May 2012 she wrotes: I wanted to avoid the fish and chips today so I chose the tomato pasta with peas but I couldn't resist some pineapple again from the salads. I don't think pineapple goes with the pasta, or maybe the pasta doesn't go with the pineapple if you see what I mean!

A new research in patients with Melanoma likely to focus on targeting multiple pathways.

melanoma patients Mutations of NRAS and BRAF genes have been identified with high frequency in nevi, cutaneous melanomas, and melanoma metastases. Prevalence of such mutations during the disease progression phases and among the different types of metastasis still remains inconclusive.
The authors investigated the prevalence and the distribution of mutations in these genes in different melanoma tissues. They screened 291 tumor tissues from 132 patients with melanoma. Paired samples of primary melanomas (102) and synchronous or asynchronous metastases from the same patients (165) were included. Tissue samples underwent mutation analysis (automated DNA sequencing). Secondary lesions included lymph nodes (84), skin (36), visceral (25), brain (44) sites.
BRAF/NRAS mutations were identified in 58% of primary melanomas (43% BRAF; 15% NRAS); 62% in lymph nodes, 61% subcutaneous, 56% visceral, and 70% in brain sites. Mutations were observed in 63% of metastases (48% BRAF; 15% NRAS), a nonsignificant increase in mutation frequency after progression from primary melanoma. Of the paired samples, lymph nodes (93% consistency) and visceral metastases (96% consistency) presented a highly similar distribution of BRAF/NRAS mutations versus primary melanomas, with a significantly less consistent pattern in brain (80%) and skin metastases (75%). This suggests that independent subclones are generated in some patients.
p16CDKN2A mutations were identified in 7% and 14% of primary melanomas and metastases, with a low consistency (31%) between secondary and primary tumor samples.

Conclusion. In the era of targeted therapies, assessment of the spectrum and distribution of alterations in molecular targets among patients with melanoma is needed. The findings about the prevalence of BRAF/NRAS/p16CDKN2A mutations in paired tumor lesions from patients with melanoma may be useful in the management of this disease. Starting from these findings, the prognostic value of such genetic alterations should be evaluated in a large cohort to assess whether the different distribution of BRAF/NRAS/p16CDKN2A mutations in tumor lesions may have an impact on disease outcome among patients with melanoma.

Short Glossary.
BRAF: BRAF is an isoform of RAF. Raf proteins (Raf-1, A-Raf, B-Raf) are intermediate to Ras and MAPK in the cellular proliferative pathway. Raf proteins are typically activated by Ras via phosphorylation, and activated Raf proteins in turn activate MAPK via phosphorylation. However, Raf proteins may also be
independently activated by other kinases.
NRAS: NRAS represents one of the three members of the Ras gene family (HRAS and KRAS are the remaining family members). The Ras proteins are typically small triphosphate-binding proteins, and are the common upstream molecule of several signaling pathways that play a key role in signal transduction, which results in cellular proliferation and transformation.
p16CDKN2A: Also known as p16, it binds to cyclin-dependent kinase 4 and 6, thereby preventing their interaction with cyclin D. It thus behaves as a negative regulator of proliferation and arrests cells in the G0/G1 phase of the cell cycle.

BRAF/NRAS Mutation Frequencies Among Primary Tumors and Metastases in Patients With Melanoma
Journal of Clinical Oncology. Published online before print: May 21, 2012, doi: 10.1200/JCO.2011.41.2452.
Authors. M. Colombino, M. Capone, M. Maio, V. De Giorgi, A. Cossu, A. Lissia, C. Rubino, B. Massidda, S. Staibano, O. Nappi, G. Botti, C. Caraco, N. Mozzillo, A. Manca, M. Sini, P. A. Ascierto, G. Palmieri.
Affiliations. Italian Melanoma Intergroup (IMI); Istituto di Chimica Biomolecolare, CNR, Sassari, Italy; Istituto Nazionale Tumori Pascale, Naples, Italy; Universita Degli Studi Di Siena -Policlinico, Siena, Italy; Department of Dermatology, University of Florence, Florence, Italy; Istituto di Anatomia Patologica, AOU, Sassari, Italy; Chirurgia Plastica, Universita di Sassari, Sassari, Italy; Department of Medical Oncology, Hospital-University, Cagliari, Italy; Dipartimento Scienze Biomorfologiche e Funzionali, Universita Federico II di Napoli, Naples, Italy; AORN Cardarelli, Naples, Italy; Istituto Nazionale Tumori, Naples, Italy

Andrea Mameli www.linguaggiomacchina.it 26 May, 2012

Una graphic novel dedicata alle cellule staminali (a story of stem cells from discovery to therapy)

Hope Beyond Hype stem cells cellule staminali Un fumetto di 16 pagine sulle cellule stminali. Una fonte di informazioni scientiche, storiche, etiche e social, che si scarica gratuitamente dal sito del progetto (per il momento è solo in inglese ma presto saranno disponibili le versioni in francese, italiano, spagnolo, tedesco) mentre la stampa è acquistabile nel sito della University of Edinburgh.
L'iniziativa è del consorzio europeo OptiStem.
I disegni sono di Edward Ross.
La sceneggiatura è di Ken Macleod.

Hope beyond hype

Hope Beyond Hype European stem cell research consortium OptiStem launched Hope Beyond Hype, a short educational comic that tells the story of stem cells from discovery to therapy. The comic starts with the true life story of two badly burned boys being treated with stem cell generated skin grafts in 1983. Whilst some of the story lines sound like science fiction they are in fact all true, despite the fact the script was written by the Science Fiction writer, Ken Macleod. Comic book artist Edward Ross illustrated the script with his clear, friendly and attractive artwork, whilst stem cell researchers from OptiStem provided the real-life examples of their research and experiences. OptiStem, a pan-European stem cell research project focused on muscle and epithelial disease, has produced this graphic story to help people engage with the process of moving basic stem cell research towards clinical trials and therapies.
The comic was produced by a team lead by Cathy Southworth (Optistem and EuroSyStem's Public Engagement, Outreach and Communications Manager) who works at the MRC Centre for Regenerative Medicine. She came up with the idea, recruited the team, showed us around the marvellous building in which the Centre is housed, introduced us to her colleagues, and arranged the immense privilege of an hour for us all with stem cell pioneer Professor Michele De Luca.

Andrea Mameli 26 maggio 2012 www.linguaggiomacchina.it

25 maggio 2012

Lo strumento musicale più antico del mondo ha 43 mila anni. Uno studio pubbllicato su Journal of Human Evolution.

primo strumento omusicale 40 mila anni fa: flauto mammuth Nella grotta di Geißenklösterle, nel sud della Germania, ricercatori delle università di Oxford e Tübingen hanno scoperto quello che viene considerato il più antico strumento musicale: un flauto di osso di Mammuth.
Nella grotta di Geißenklösterle sono stati trovati ornamenti realizzati con ossa e denti di animali (Credits: Universitaet Tübingen).
Per determinare la nuova datazione, compresa fra 42 e 43 mila anni fa è stato utilizzato un nuovo metodo di riduzione delle contaminazioni dei reperti prima di effettuare la radiodatazione.
Lo studio, pubblicato sulla rivista Journal of Human Evolution l'8 maggio 2012 porta la firma di Thomas Higham, Laura Basell, Roger Jacobi, Rachel Wood, Christopher Bronk Ramsey, Nicholas J. Conard.
Τesting models for the beginnings of the Aurignacian and the advent of figurative art and music: The radiocarbon chronology of Geißenklösterle.
The German site of Geißenklösterle is crucial to debates concerning the European Middle to Upper Palaeolithic transition and the origins of the Aurignacian in Europe. Previous dates from the site are central to an important hypothesis, the Kulturpumpe model, which posits that the Swabian Jura was an area where crucial behavioural developments took place and then spread to other parts of Europe. ornamenti The previous chronology (critical to the model), is based mainly on radiocarbon dating, but remains poorly constrained due to the dating resolution and the variability of dates. The cause of these problems is disputed, but two principal explanations have been proposed: a) larger than expected variations in the production of atmospheric radiocarbon, and b) taphonomic influences in the site mixing the bones that were dated into different parts of the site. We reinvestigate the chronology using a new series of radiocarbon determinations obtained from the Mousterian, Aurignacian and Gravettian levels. The results strongly imply that the previous dates were affected by insufficient decontamination of the bone collagen prior to dating. Using an ultrafiltration protocol the chronometric picture becomes much clearer. Comparison of the results against other recently dated sites in other parts of Europe suggests the Early Aurignacian levels are earlier than other sites in the south of France and Italy, but not as early as recently dated sites which suggest a pre-Aurignacian dispersal of modern humans to Italy by ∼45000 cal BP. They are consistent with the importance of the Danube Corridor as a key route for the movement of people and ideas. The new dates fail to refute the Kulturpumpe model and suggest that Swabian Jura is a region that contributed significantly to the evolution of symbolic behaviour as indicated by early evidence for figurative art, music and mythical imagery.
Andrea Mameli 25 maggio 2012 www.linugaggiomacchina.it

24 maggio 2012

Microgocce di cristalli liquidi. Video e foto: CNR.

Le microgocce di cristalli liquidi ottenute dai ricercatori dell’Istituto nazionale di Ottica Ino-Cnr di Napoli, dell'Istituto di chimica e tecnologia dei polimeri (Ictp-Cnr) e dell'Università degli studi di Napoli Federico II.
[Fluidi come liquidi. Ordinati come cristalli. Scoperta dell’istituto Ino-Cnr di Napoli (Linguaggio Macchina, 24 maggio 2012)]


Processo di aggregazione di goccioline di cristalli liquidi, precedentemente frammentate, in seguito ad una variazione di temperatura che genera un campo elettrico. Ciò è reso possibile dal substrato di niobato di litio (materiale piroelettrico) ricoperto dal polimero PDMS. Video: CNR.


Zoom del processo di aggregazione del video 1 in cui si vedono le goccioline di cristallo liquido che formano gocce più grandi, eventualmente utilizzabili come lenti microscopiche. Video: CNR.

Microgocce cristalli liquidi effetto piroelettrico strutture polimeriche
Microgocce di cristalli liquidi guidate per effetto piroelettrico all’esterno di strutture polimeriche (PDMS). Dimensioni reali dell'immagine: 500x400 micron. Foto: CNR

Microgocce di cristalli liquidi
Microgocce di cristalli liquidi che si “auto-assemblano” per effetto piroelettrico all’interno di strutture sferiche di PDMS. Foto: CNR

Zoom di una struttura polimerica
Zoom di una struttura polimerica
Zoom di una struttura polimerica (circa 100 micron, cioè 0,1mm) sulla quale le microgocce di cristallo liquido si sono assemblate seguendo le linee del campo elettrico generato termicamente. Foto: CNR

gocce raccolte
Situazione finale in cui le microgocce di cristallo liquido si sono raccolte per formare una goccia più grande che può essere sfruttata da microlente (al centro).Foto: CNR

Fluidi come liquidi. Ordinati come cristalli. Scoperta dell’istituto Ino-Cnr di Napoli

Fluidi come liquidi. Ordinati come cristalli. Scoperta dell’istituto Ino-Cnr di Napoli.

cristalli liquidi CNR Gocce microscopiche di cristalli liquidi. Le hanno ottenute ricercatori dell’Istituto nazionale di Ottica Ino-Cnr di Napoli, dell'Istituto di chimica e tecnologia dei polimeri (Ictp-Cnr) e dell'Università degli studi di Napoli Federico II.
Lo studio, pubblicato su Advanced Functional Materials con il titolo Reversible Fragmentation and Self-Assembling of Nematic Liquid Crystal Droplets on Functionalized Pyroelectric Substrates è stato inserito tra le scoperte più rilevanti (Hot Topics) dalla casa editrice scientifica Wiley-VCH.
La notizia è significativa per le innovazioni che potrebbero discendere da questa scoperta. È noto che i cristalli liquidi in particolari condizioni si organizzano in fasi intermedie che presentano simultaneamente le caratteristiche dello stato liquido e dello stato solido, peculiarità che ne hanno permesso un larghissimo impiego per la costruzione asvariati oggetti di uso quotidiano basati sui display a cristalli liquidi.
«Per la prima volta - spiega Simonetta Grilli dell’Ino-Cnr - i cristalli liquidi sono stati frammentati in goccioline microscopiche che possono assemblarsi nuovamente in gocce più grandi tramite un processo reversibile. In particolare le ‘goccioline’ possono diventare microlenti con focale variabile in grado di offrire inaspettate soluzioni in fotografia, per mettere contemporaneamente a fuoco oggetti a diverse profondità, e nel fotovoltaico, per catturare la luce solare da qualunque angolazione con una lente di forma sferica. Altre applicazioni si aprono in sensoristica e nelle nano e biotecnologie».

Secondo Francesco Merola dell’Ino-Cnr: «La ricerca è partita dall’idea di manovrare a piacimento piccole quantità di queste sostanze. Per concretizzarla abbiamo depositato delle goccioline di cristallo liquido su un substrato di niobato di litio appositamente preparato e ricoperto con un particolare polimero, il polidimetilsiloxano, o pdms. Sfruttiamo una variazione di temperatura per generare il campo elettrico invece di applicarlo dall’esterno: nessuno, fino ad ora, aveva mai pensato a una tecnica del genere».
[Foto e video CNR]
Andrea Mameli www.linguaggiomacchina.it 24 maggio 2012

Uno studio su percezione visiva e decisioni pubblicato su Frontiers of Perception Science Psychology.

percezione Uno studio condotto da ricercatori Center for the Neural Basis of Cognition (CNBC) della Carnegie Mellon University mostra che il sistema di percezione visiva guida i processi decisionali in maniera automatica e inconscia attraverso la percezione visiva. I risultati di questa ricerca possono offrire importanti sviluppi nello studio del comportamento dei consumatori, ad esempio per valutare quanto la percezione visiva influisce sul comportamento dei consumatori. Inoltre aziende come YouTube e Hulu sono alla ricerca di nuove modalità per mantenere gli utenti sui loro siti: la scelta delle miniature rappresenta un problema rilevante per qualsiasi sito di video online, e questa ricerca potrebbe aiutare a sceglie lo screenshot più accattivante.
La ricerca, pubblicata il 17 Aprile 2012 nella rivista Frontiers of Perception Science Psychology è firmata da Lebrecht S, Bar M, Barrett LF, Tarr MJ
CNBC study peception Micro-valences: perceiving affective valence in everyday objects
Perceiving the affective valence of objects influences how we think about and react to the world around us. Conversely, the speed and quality with which we visually recognize objects in a visual scene can vary dramatically depending on that scene’s affective content. Although typical visual scenes contain mostly “everyday” objects, the affect perception in visual objects has been studied using somewhat atypical stimuli with strong affective valences (e.g., guns or roses). Here we explore whether affective valence must be strong or overt to exert an effect on our visual perception. We conclude that everyday objects carry subtle affective valences – “micro-valences” – which are intrinsic to their perceptual representation.

23 maggio 2012

Computer grafica: e la cultura diventa virtuale (Almanacco della Scienza, CNR, 23 maggio 2012).

Computer grafica Almanacco della Scienza CNR Si è svolta a Cagliari dal 13 al 18 maggio 'Eurographics 2012', conferenza annuale dell'European Association of Computer Graphics, organizzata dal centro di ricerca Crs4 in collaborazione con l'Università di Cagliari. L'evento rappresenta la più importante piattaforma europea di confronto per la comunità scientifica che si occupa di computer grafica: 400 i partecipanti, oltre 130 gli appuntamenti tra presentazioni di pubblicazioni scientifiche, colloqui industriali e tutorial.
Grazie alla collaborazione fra Crs4, Hewlett Packard, Nvidia e Projectiondesign, inoltre, per tre giorni è stata aperta una 'virtual room' nella quale era disponibile un sistema per la visualizzazione multirisoluzione in tempo reale di modelli di enormi dimensioni, con l'uso combinato di due proiettori ad altissima risoluzione.
Il convegno vede da diversi anni una forte partecipazione del Cnr: a 'Eurographics 2012' erano presenti Roberto Scopigno, Massimiliano Corsini, Nico Pietroni, Francesco Banterle, Paolo Cignoni - quest'ultimo co-chair del comitato scientifico - e Matteo Delle Piane dell'Istituto di scienza e tecnologie dell'informazione 'A. Faedo' di Pisa. L'Isti-Cnr è una realtà di ricerca che sviluppa sistemi per la visualizzazione e la navigazione interattiva di modelli 3D e per l'integrazione di dati con altre tipologie di informazione proprie delle applicazioni web e degli ambienti di realtà virtuale.
"L'Istituto ha presentato alcuni lavori riguardanti la linea di ricerca grafica 3D e sistemi interattivi per la fruizione e la conoscenza dei beni culturali, su cui è impegnato da anni e consolidando visibilità e competenza internazionale grazie a numerose collaborazioni con enti di restauro, di conservazione e musei", spiega Roberto Scopigno, già presidente dell'Associazione europea di computer graphics nel biennio 2009-2010. "Da oltre 15 anni, inoltre, è attiva una collaborazione con le istituzioni che hanno organizzato il convegno, in particolare con il gruppo di Enrico Gobbetti di Crs4 e di Riccardo Scateni dell'Università di Cagliari".
'Eurographics 2012' ha rappresentato anche un'occasione di confronto internazionale: "È stato un ottimo momento di discussione e di contatto con soggetti con cui l'Isti-Cnr collabora: il Max Planck di Starbrucken, l'Università Politecnica di Barcellona, la Tecnhical University di Vienna e la Fraunhofer di Darmstadt", conclude il ricercatore.
Andrea Mameli
Almanacco della Scienza CNR, Quindicinale a cura dell’Ufficio Stampa del Consiglio Nazionale delle Ricerche. N. 9 - 23 mag 2012

Fonte: Roberto Scopigno , Istituto di scienza e tecnologie dell'informazione "Alessandro Faedo", Pisa, tel. 050/3152929, email r.scopigno@isti.cnr.it
Per saperne di più: - www.youtube.com/watch?v=01w5IPBSVQM

Eurographics 2012: a video interview with Holly Rushmeier

22 maggio 2012

Interview with Holly Rushmeier. Eurographics 2012, Cagliari (Linguaggio Macchina, 22 magio 2012)

Holly Rushmeier Holly Rushmeier (Professor of Computer Science and Chair at Yale University) was in Cagliari for Eurographics 2012 and she kindly accepted to answer my questions. The last keynote was dedicated to your talk "Material Appearance Modeling" where you showed applications several fields as industrial design and cultural heritage.
May you summarize this connections between research and technology in a few words?
«Applications such as industrial design and cultural heritage are always posing new questions and defining new requirements. These questions and requirements inspire new ideas that push the research forward».
You point your attention also on Computer Graphics applications in biology, in particular about relationship between graphics and perception of birds. What conclusions do you reach?
«This work is still in progress. We have the system built to gather the data. The biologists still have to use the data to make their conclusions about how bird vision co-evolved with their appearance».
What can you say about the organization of Eurographics 2012 and about the quality of scientific simposium?
«The organization and quality of Eurographics was excellent this year. The sessions all ran smoothly, and there was a very interesting exhibition of new products in addition to the technical content. There were many important and inspiring papers presented, including papers on inexpensive hyperspectral scanning and methods for selecting procedural textures and reflectances for modeling new scenes».
What is your opinion about the city of Cagliari?
«Visiting the city was a wonderful experience. I had been unaware of the history, such as the 400 years of Spanish/Catalonian rule. I enjoyed seeing the nature preserve, and the incredible number of flamingos. I also had a good time looking around at the shops».
Andrea Mameli www.linguaggiomacchina.it 22 May, 2012

  • From The Rise of Big Data (The New York Academy of Sciences, Diana Friedman, March 16, 2012):
    Data visualization takes numbers that are either generated by a large calculation or acquired with a measurement and turns them into pictures, says Holly Rushmeier, chair and professor, Department of Computer Science, Yale University, and a judge for the Academy's Blavatnik Awards for Young Scientists. For example, a project might take numbers representing flow going through a medium and turn them into an animation.

    "Visualization allows you to look at a large volume of numbers and look for patterns, without having a preconceived notion of what that pattern is," says Rushmeier. In this way, visualization is both a powerful debugging tool (allowing researchers to see, through the creation of a nonsensical picture, if there might be a flaw with their data) and an important means for communication of data, whether to other researchers or to the general public (as in the case of weather forecasts). So perhaps the old adage needs to be re-written: Is a picture now worth a thousand lines of code?

    "There are many flavors of visualization," says Rushmeier. Information can be mapped onto a natural structure, such as valves being mapped onto the heart, or an entirely new picture can be created (data without a natural structure is referred to as high-dimensional data). The classic example of high-dimensional data is credit card data, says Rushmeier, "but there is a lot of high-dimensional data in science."

    Rushmeier is currently immersed in 3D mapping, working closely with an ornithologist who studies bird vision. He records light waves to which birds are sensitive, from the UV to the infrared, to get a better sense of how bird vision evolved and for what purposes (e.g., mating and survival). Through 3D mapping, Rushmeier is able to take the ornithologist's numerical data and simulate the actual viewpoint of the bird onto different 3D surfaces.

  • Experimental Microscopic RTI Dome (by chicaseyc, April 20, 2012):
    I particularly appreciated a discussion with Holly Rushmeier from Yale University about what we mean by accuracy, high resolution, and quality in general? In particular what is even measurable, and how should we be measuring and recording it? Holly agreed that this is an area that needs some attention, and it will take the work of multiple institutions working together to come to any guidelines.

21 maggio 2012

Lo strano caso di Phineas Gage. Connectogram. Uno studio pubblicato su PLoS ONE il 16 maggio 2012.

Phineas Gage Nel 1998 ho letto L'Errore di Cartesio di Antonio Damasio. Ricordo di aver apprezzato la brillante trattazione con la quale il neuroscienziato portoghese nega la concezione cartesiana di dualismo corpo-mente sostenendo l'esistenza di un organismo unico e inseparabile. Mi piaceva questa sua ipotesi di vicinanza tra emozione e ragione. Ma mi intrigavano ancor più alcuni esempi basati su osservazioni dei suoi pazienti con deficit neurologici. Uno in particolare mi è rimasto particolarmente impresso: il caso di Phineas Gage. Phineas Gage Nel 1848 Phineas Gage lavorava alla costruzione di una ferrovia in Vermont: il suo compito era far esplodere le rocce affioranti. Era una persona seria e onesta, sapeva scherzare e farsi rispettare. Un giorno, per un'esplosione accidentale, una barra di ferro gli trapassò il cranio, dalla guancia sinistra al lobo prefrontale della corteccia cerebrale, ma non lo uccise. Ma da allora non fu più la stessa persona. Phineas Gage era diventato un uomo scorbutico, inaffidabile, bugiardo e bizzarro. E non si era accorto di essere cambiato. Morì tredici anni dopo l'evento. La sua storia è nota a tutti gli studenti di neuroscienze e di psicologia. Oggi, grazie a Jack Van Horn del Laboratorio di Neuroimaging dell'Università della California a Los Angeles (LONI), la storia di Phineas Gage è entrata nel progetto Human Connectome. Lanciato nel luglio del 2009 con decine di milioni di dollari di finanziamento da parte del National Institutes of Heath, questo ambizioso progetto ha come obiettivo la costruzione di una mappa delle connessioni cerebrali, con la speranza che ciò possa essere utile nella comprensione del cervello umano e delle sue criticità.
Connectogram cervello sano Partendo dalla ricostruzione tridimensionale del cranio di Phineas Gage (2004) Jack Van Horn e i suoi collaboratorio hanno provato a ricostruire la connettività nel cervello di Gage, raffigurando a materia bianca con dei diagrammi circolari e le regioni del cervello più importanti (lobo frontale, insula, sistema limbico, lobo temporale, lobo parietale, lobo occipitale, tronco cerebrale e cervelletto) assumono a colori e posizioni in base alla loro posizione. In questo modo si è creata una mappa, denominata "Connectogram" rappresentativa delle connesioni interne al cervello. l primo si riferisce a un cervello sano. Connectiongram Phineas Cage Il secondo identifica le connessioni del cervello di Gage.
Van Horn e i suoi colleaghi stimano che l'asta possa aver distrutto circa il 4% della corteccia cerebrale e circa l'11% della materia totale bianca nel lobo frontale. Secondo il loro modello, l'incidente avrebbe danneggiato alcune delle vie principali della sostanza bianca e i collegamenti della corteccia frontale, regioni ad alta densità di connessioni con gli altri settori.
Andrea Mameli www.linguaggiomacchina.it 21 maggio 2012

La ricerca è pubblicata su PLoS ONE il 16 maggio 2012 con il titolo: Mapping Connectivity Damage in the Case of Phineas Gage
White matter (WM) mapping of the human brain using neuroimaging techniques has gained considerable interest in the neuroscience community. Using diffusion weighted (DWI) and magnetic resonance imaging (MRI), WM fiber pathways between brain regions may be systematically assessed to make inferences concerning their role in normal brain function, influence on behavior, as well as concerning the consequences of network-level brain damage. In this paper, we investigate the detailed connectomics in a noted example of severe traumatic brain injury (TBI) which has proved important to and controversial in the history of neuroscience. We model the WM damage in the notable case of Phineas P. Gage, in whom a “tamping iron” was accidentally shot through his skull and brain, resulting in profound behavioral changes. The specific effects of this injury on Mr. Gage's WM connectivity have not previously been considered in detail. Using computed tomography (CT) image data of the Gage skull in conjunction with modern anatomical MRI and diffusion imaging data obtained in contemporary right handed male subjects (aged 25–36), we computationally simulate the passage of the iron through the skull on the basis of reported and observed skull fiducial landmarks and assess the extent of cortical gray matter (GM) and WM damage. Specifically, we find that while considerable damage was, indeed, localized to the left frontal cortex, the impact on measures of network connectedness between directly affected and other brain areas was profound, widespread, and a probable contributor to both the reported acute as well as long-term behavioral changes. Yet, while significantly affecting several likely network hubs, damage to Mr. Gage's WM network may not have been more severe than expected from that of a similarly sized “average” brain lesion. These results provide new insight into the remarkable brain injury experienced by this noteworthy patient.

3D reconstruction of Phineas Gage's skull, showing the passage of the tamping iron. From Ratiu, P., et al. (2004).

Gage bain

Ohibò! Ho una trave nell’occhio (Davide Ludovisi, Oggi Scienza, 18 maggio 2012)

20 maggio 2012

Scoperti graffiti di 37 mila anni fa in una grotta francese.

arte rupestre Abri Castanet La scoperta, documentata nell'ultimo numero di PNAS (Context and dating of Aurignacian vulvar representations from Abri Castanet, France) porta la firma di 16 ricercatori e si è svolta nella grotta di Abri Castanet (Francia) nel corso degli ultimi 15 anni. Abri Castanet (e la grotta gemella Abri Blanchard) sono noti da tempo come i luoghi con tracce di simboli umani in tutta l'Eurasia. Vi sono stati scoperti entinaia di ormanenti.
I disegni della celebre grotta di Chauvet sono stati fatti risalire a un periodo compreso fra 30 mila e 36 mila anni fa. Le incisioni e i dipinti di Abri Castanet risalirebbero invece a 37 mila anni fa. Le testimonianze artistiche di Chauvet si trovano lontano dalle aree abitate, mentre le pitture e le incisioni di Abri Castanet sono associabili alla vita quotidiana, se si considera la presenza di ossa e denti di animale, attrezzi e ornamenti.
Andrea Mameli 20 maggio 2012 www.linguaggiomacchina.it

pietre incise Titolo Context and dating of Aurignacian vulvar representations from Abri Castanet, France
Autori Randall White, Romain Mensan, Raphaëlle Bourrillon, Catherine Cretin, Thomas F. G. Higham, Amy E. Clark, Matthew L. Sisk, Elise Tartar, Philippe Gardère, Paul Goldberg, Jacques Pelegrin, Hélène Valladas, Nadine Tisnérat-Laborde, Jacques de Sanoit, Dominique Chambellan, Laurent Chiotti
Abstract ossa, denti materiali We report here on the 2007 discovery, in perfect archaeological context, of part of the engraved and ocre-stained undersurface of the collapsed rockshelter ceiling from Abri Castanet, Dordogne, France. The decorated surface of the 1.5-t roof-collapse block was in direct contact with the exposed archaeological surface onto which it fell. Because there was no sedimentation between the engraved surface and the archaeological layer upon which it collapsed, it is clear that the Early Aurignacian occupants of the shelter were the authors of the ceiling imagery. This discovery contributes an important dimension to our understanding of the earliest graphic representation in southwestern France, almost all of which was discovered before modern methods of archaeological excavation and analysis. Comparison of the dates for the Castanet ceiling and those directly obtained from the Chauvet paintings reveal that the “vulvar” representations from southwestern France are as old or older than the very different wall images from Chauvet.